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在喷泉得到广泛应用的过程中，也出现了一些问题和不足，有些认识上的误区和不良倾向应该引起人们的重视。否则将对喷泉设计行业的健康发展产生负面影响。
1.方案设计上的盲目性，往往导致作品成为败笔，使作品难于长久存在。
2.细部设计的不合理直接影响作品效果。
3.质次价高的伪劣产品直接影响着有关厂商和公司的信誉。
4.节能、节水、环保问题应引起足够的重视。
好的喷泉方案设计需要喷泉专业的设计人员充分听取和吸纳喷泉所在地的规划师、建筑师、园艺师及建设单位等相关人士的建议和意见，因时、因地的拿出合理的方案设计，喷泉的水池和喷水造型应该与周边的环境、空间、建筑、绿化形成协调的关系，适于安静、幽雅的氛围就不宜搞成热烈、活跃的效果。以激光彩色音乐喷泉为例，国外一般多设在旅游景点的公园或游乐场和文化公园里，设有观赏的座位，使人们可以驻足休闲欣赏喷泉。而我们有的城市则设在空间狭小、交通流量大，而且不具备停车条件的道路旁或交通环岛中心，很显然这种选择是不科学、不合理的。喷泉很容易造成交通堵塞。
喷泉是耗能的景观工程，有些超高水柱或大型激光彩色音控喷泉其动力及灯光耗能上千或数千瓦，也就是说，喷泉一天只要开两个小时，就要耗数千度电，对于喷泉项目投资和日后的维持运行都是很大的费用，需要进行认真论证、评估。在保障喷泉设计效果的前提下，尽可能地节约能源，这在喷泉方案设计阶段时就应该进行量体裁衣的设计。
音乐喷泉设计中喷泉的曲目编曲—对音乐喷泉创意和编排的要求一般情况下，高音区的音符经常和明亮的视觉感受、积极或快乐的情态感受等联系在一起，低音区的音符经常和昏暗的视觉感受、消沉或哀伤的情态感受等联系在一起；舒缓的节奏容易让人感受到开阔的空间或较为平静的情绪，而急促的节奏则容易让人感到空间狭窄、情绪躁动等等。喷泉曲目的编配就是根据通感的想象来组态各种水型，诠释一个音乐节奏、旋律、情感、意境，从听觉感受到视觉形象的过程。